过渡态方法理论
转载自 计算化学公社http://sobereva.com/44 卢天老师的文章
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2.1 基于初猜结构的算法
2.1.1 牛顿-拉弗森法(Newton-Raphson,NR)与准牛顿法(quasi-Newton,QN)
2.1.2 AH方法(augmented Hessian)
2.1.2.1 RFO法(Rational Function Optimization，有理函数优化)
2.1.2.2 P-RFO法(Partitioned-RFO)
2.1.2.3 QA法(Quadratic Approximation，二次逼近)
2.1.2.4 TRIM法(trust-region image minimization，置信区域镜像最小化)
2.1.2.5 在高斯中的常见问题
2.1.3 GDIIS法(Geometry Direct Inversion in the Iterative Subspace)
2.1.4 梯度模优化(gradient norm minimization)
2.1.5 Dimer方法
2.2 基于反应物与产物结构的算法
2.2.1 同步转变方法(synchronous transit,ST) 2.2.2 STQN方法(Combined Synchronous Transit and Quasi-Newton Methods) 2.2.3 赝坐标法(pseudo reaction coordinate) 2.2.4 DHS方法(Dewar-Healy-Stewart，亦称Saddle方法)与LTP方法(Line-Then-Plane) 2.2.5 Ridge方法 2.2.6 Step-and-Slide方法 2.2.7 Müller-Brown方法 2.2.8 CI-NEB、ANEBA方法 2.3 基于反应物结构的算法 2.3.1 最缓上升法(least steep ascent,shallowest ascent) 2.3.2 本征向量/本征值跟踪法(eigenvector/eigenvalue following,EF。也称mode walking/mode following/Walking up valleys) 2.3.3 ARTn(activation-relaxation technique nouveau) 2.3.4 梯度极值法(Gradient extremal,GE) 2.3.5 约化梯度跟踪(reduced gradient following,RGF) 2.3.6 等势面搜索法(Isopotenial Searching) 2.3.7 球形优化(Sphere optimization) 2.4 全势能面扫描
过渡态相关问题 3.1 无过渡态的反应途径(barrierless reaction pathways) 3.2 Hammond-Leffler假设 3.2 对称性问题 3.3 溶剂效应 3.4 计算过渡态的建议流程
IRC算法 5.1 最陡下降法(Steepest descent) 5.2 IMK方法(Ishida-Morokuma-Kormornicki) 5.3 Müller-Brown方法 5.4 GS(Gonzalez-Schlegel)方法
chain-of-states方法 6.1 Drag method方法 6.2 PEB方法(plain elastic band) 6.3 Elber-Karplus方法 6.4 SPW方法(Self-Penalty Walk) 6.5 LUP方法(Locally Updated planes) 6.6 NEB方法(Nudged Elastic Band) 6.7 DNEB方法(Double Nudged Elastic Band) 6.8 String方法 6.9 Simplified String方法 6.10 寻找过渡态的chain-of-state方法 6.10.1 CI-NEB方法 6.10.2 ANEBA方法(adaptive nudged elastic band approach) 6.11 chain-of-states方法的一些特点 6.12 高斯中opt关键字的path=M方法 6.13 CPK方法(Conjugate Peak Refinement)